110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2705 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 173 aa  318  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.87 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  42.26 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  38.31 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  37.66 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.99 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.29 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.87 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1891  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.52 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  29.87 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.13 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  28.3 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  35.16 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  36.47 
 
 		 129 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.11 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2537  FxsA  45.74 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291764  normal  0.606728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2500  FxsA  45.74 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2545  FxsA  45.74 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  36.19 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.86 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.61 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  35.29 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  35.29 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  35.29 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  35.29 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  37.5 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.71 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  40 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.99 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12090  FxsA  41.18 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0508587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.58 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.01 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.95 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  36.84 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.95 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.95 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.95 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.74 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  25.95 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.41 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  36.84 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3115  FxsA  42.34 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  25.32 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.79 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  26.32 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.5 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  37.5 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  36.36 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.4 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.36 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1141  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.87 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14100  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  36.94 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0286882  normal  0.429817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.46 
 
 		 215 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.87 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.24 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2197  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.19 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  34.55 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.25 
 
 		 131 aa  52  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.85 
 
 		 217 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.43 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.81 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.23 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.21 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  34 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  36 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.17 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1761  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  33.54 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0813114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  28.77 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0700  inner membrane protein FxsA  22.35 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  24.12 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.54 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  26.81 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  31.52 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.66 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  26.81 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.72 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.79 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.09 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.04 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.49 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.71 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  32.28 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.81 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2271  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.53 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237606  normal  0.0291339 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  28.74 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  28.74 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  28.74 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  33.63 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  33.63 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  33.63 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  33.63 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  33.63 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.77 
 
 		 130 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0672  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.2 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.05 
 
 		 206 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  32.28 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  32.28 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2390  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.16 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260123  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2963  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.42 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>