73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1891 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1891  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 183 aa  332  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.68 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.29 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.43 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.17 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  36.31 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.76 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.48 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0700  inner membrane protein FxsA  28.68 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.4 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  38 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  38 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.65 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.12 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 131 aa  50.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3115  FxsA  37.34 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.68 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  24.69 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.3 
 
 		 132 aa  48.5  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.57 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.98 
 
 		 130 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.31 
 
 		 154 aa  48.9  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.17 
 
 		 158 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  28.57 
 
 		 129 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  28.69 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  26.12 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  28.57 
 
 		 129 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.85 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.79 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0672  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.98 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.95 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.17 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0670  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.68 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.37 
 
 		 131 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.46 
 
 		 131 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.84 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  26.79 
 
 		 129 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  30.56 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2537  FxsA  41.57 
 
 		 155 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291764  normal  0.606728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.66 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2963  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.43 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  26.79 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38890  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  37.6 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.700662  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  26.79 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2500  FxsA  41.57 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2197  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.3 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  26.79 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  26.79 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.41 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  28.69 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.66 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.69 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.66 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2545  FxsA  41.57 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.66 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  25 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  25.89 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.1 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.25 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.05 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.49 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  31.25 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  31.25 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  31.25 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  30.21 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  31.25 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  31.25 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  24.4 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  31.67 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.14 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  31 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.43 
 
 		 217 aa  40.8  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  23.53 
 
 		 137 aa  40.8  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>