More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0779 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  100 
 
 
463 aa  932    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  70.02 
 
 
467 aa  631  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  69.83 
 
 
470 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  62.72 
 
 
467 aa  541  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  62.93 
 
 
467 aa  544  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  59.44 
 
 
468 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  59.65 
 
 
481 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  59.21 
 
 
463 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  58.84 
 
 
471 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  58.79 
 
 
470 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  59 
 
 
470 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  59 
 
 
470 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  58.84 
 
 
495 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.37 
 
 
464 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  60.34 
 
 
467 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  58.68 
 
 
460 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  57.97 
 
 
467 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  60.3 
 
 
460 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  56.07 
 
 
493 aa  501  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  56.56 
 
 
479 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  57.44 
 
 
483 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  58.28 
 
 
491 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  56.68 
 
 
471 aa  491  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  55.82 
 
 
465 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  59.31 
 
 
463 aa  478  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  55.53 
 
 
471 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  58.41 
 
 
467 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  53.44 
 
 
491 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  53.76 
 
 
468 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  52.14 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  52.25 
 
 
478 aa  438  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  52.27 
 
 
506 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  52.45 
 
 
476 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  53.93 
 
 
495 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  53.22 
 
 
478 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  54.27 
 
 
480 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.79 
 
 
458 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 
458 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 
470 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.5 
 
 
465 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.11 
 
 
459 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 
468 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.38 
 
 
465 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.85 
 
 
492 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.99 
 
 
491 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 
470 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.72 
 
 
465 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 
585 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.4 
 
 
478 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.15 
 
 
468 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.48 
 
 
462 aa  216  7e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.24 
 
 
465 aa  216  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.57 
 
 
616 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.19 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  33.92 
 
 
468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 
479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.77 
 
 
465 aa  212  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.78 
 
 
465 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.1 
 
 
459 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.88 
 
 
473 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.1 
 
 
459 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  33.19 
 
 
468 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.13 
 
 
470 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.7 
 
 
459 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.79 
 
 
468 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.18 
 
 
479 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.57 
 
 
464 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.84 
 
 
462 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.18 
 
 
480 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.47 
 
 
480 aa  207  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.14 
 
 
470 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.14 
 
 
470 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.14 
 
 
470 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
478 aa  206  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.82 
 
 
460 aa  206  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.1 
 
 
472 aa  205  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
470 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.25 
 
 
459 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.43 
 
 
468 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 
465 aa  205  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
470 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
470 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.81 
 
 
474 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
470 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
470 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.89 
 
 
473 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
470 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.67 
 
 
466 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
470 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.79 
 
 
464 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
462 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.46 
 
 
462 aa  203  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.79 
 
 
463 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.25 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.45 
 
 
473 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.06 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.03 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
473 aa  202  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>