140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0715 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0715  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 86 aa  169  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0769  preprotein translocase, YajC subunit  39.47 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000195822  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  33.72 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  31.51 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  30 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  29.49 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  29.49 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  26.19 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  36.49 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  32.88 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  31.71 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  26.92 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  30.56 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  29.41 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  28.21 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  27.4 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  29.17 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  27.4 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  28.24 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  35.8 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  28.21 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  28.21 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  28.4 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  32.1 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  31.25 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  34.21 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  34.57 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  34.25 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  31.82 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  25.97 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  29.11 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  27.4 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  32.47 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  32.1 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  27.71 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  32.5 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  32.5 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  32.5 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  32.5 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  32.1 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  32.5 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  25.64 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  26.92 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  27.38 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  32.1 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  28.24 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  28.77 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  32.5 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  32.1 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  30.38 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  32.39 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  29.11 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  22.35 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  31.76 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  31.33 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  28.38 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0564  preprotein translocase, YajC subunit  28.75 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  20.51 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  26.19 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  30.86 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  25.32 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  31.25 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  30.26 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  30.38 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1229  preprotein translocase subunit YajC  27.91 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  21.69 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  30.95 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  23.53 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  26.09 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>