More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4715 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 415 aa  837    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  69.75 
 
 		 406 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  44.33 
 
 		 408 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  43.63 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  45.26 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  42.36 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  44.36 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  44.5 
 
 		 443 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  44.88 
 
 		 407 aa  293  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  38.48 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  39.7 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  43.63 
 
 		 428 aa  288  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  43.9 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  41.69 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  39.41 
 
 		 405 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 		 423 aa  285  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  40.83 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  40.19 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  39.23 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  38.7 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  39.71 
 
 		 406 aa  272  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  44.61 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  38.86 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  34.79 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  42.65 
 
 		 425 aa  266  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 		 411 aa  265  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  39.02 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  38.87 
 
 		 385 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 		 417 aa  235  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  37.79 
 
 		 460 aa  229  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  37.84 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 		 412 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 		 390 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  30.15 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  30.55 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 		 518 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  26.69 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  43.75 
 
 		 188 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  43.75 
 
 		 188 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.48 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  30.3 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 		 396 aa  67  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  25.06 
 
 		 650 aa  63.9  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  23.48 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.92 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  29.74 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  27.8 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  21.02 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  27.52 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.35 
 
 		 745 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  26.14 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  25.69 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  21.05 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>