More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3886 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3886  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 330 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5578  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  71.04 
 
 		 328 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  66.14 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2432  alcohol dehydrogenase  62.46 
 
 		 376 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  60.57 
 
 		 315 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0521  putative Zn-containing dehydrogenase  59.38 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.03 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.11 
 
 		 319 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.11 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00941244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.11 
 
 		 319 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0715122  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5595  zinc-binding oxidoreductase  49.55 
 
 		 347 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3218  alcohol dehydrogenase  49.05 
 
 		 332 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0832  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.22 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.61 
 
 		 200 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.82 
 
 		 346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  23.38 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.61 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.97 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.78 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.55 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.07 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.97 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.36 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  26.93 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 		 324 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.79 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  28.21 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.21 
 
 		 371 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.21 
 
 		 371 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.14 
 
 		 335 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  26.21 
 
 		 371 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 		 369 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.5 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  28.4 
 
 		 362 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.4 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.45 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  27.52 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  27.3 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.65 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  28.57 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.52 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.84 
 
 		 326 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  26.91 
 
 		 408 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  28.25 
 
 		 325 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.35 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.83 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  29.48 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  26.91 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.84 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  31.39 
 
 		 345 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.36 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  27.58 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.72 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  30.55 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.97 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 		 373 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  29.03 
 
 		 325 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.77 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.7 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  33.19 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.69 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  30.8 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  26.59 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.63 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.92 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.99 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  26.84 
 
 		 362 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.78 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.19 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.09 
 
 		 357 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0952  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.9 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000662515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  33.19 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  33.19 
 
 		 342 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.51 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  27.57 
 
 		 363 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.94 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.29 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.73 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.29 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>