More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3695 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3695  threonine dehydratase  100 
 
 		 334 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5519  threonine dehydratase  75.68 
 
 		 333 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0114285 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5240  threonine dehydratase  75.15 
 
 		 333 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3469  threonine dehydratase  65.71 
 
 		 324 aa  362  6e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  56.74 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  57.68 
 
 		 323 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  57.1 
 
 		 344 aa  338  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4430  threonine dehydratase  57.28 
 
 		 330 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  56.6 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0285  threonine dehydratase  65.09 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.832074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  59.33 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  56.43 
 
 		 323 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  59.33 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4376  ectoine utilization protein EutB  59.13 
 
 		 325 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  59 
 
 		 323 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3175  threonine dehydratase  65.57 
 
 		 318 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.465407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2151  threonine dehydratase  56.91 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme beta subunit  47.39 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2723  threonine dehydratase  50.87 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  41.19 
 
 		 403 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  36.16 
 
 		 403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  42.99 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  41.51 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  41.4 
 
 		 405 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  39.74 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  41.19 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  41.19 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  37.18 
 
 		 402 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.48 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  37.61 
 
 		 403 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  39.94 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  43.21 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  40.81 
 
 		 404 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  41.85 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  41.74 
 
 		 410 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  39.12 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  42.9 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  40.58 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  41.72 
 
 		 443 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  39.61 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  40.89 
 
 		 415 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  41.32 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  40.07 
 
 		 506 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  40.07 
 
 		 506 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  37.3 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  37.42 
 
 		 403 aa  189  8e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  36.1 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  38.1 
 
 		 511 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  39.94 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  39.94 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  37.1 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 504 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  41.82 
 
 		 401 aa  185  8e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  41.82 
 
 		 401 aa  185  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  35.28 
 
 		 402 aa  185  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 504 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  36.77 
 
 		 403 aa  185  9e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  39.46 
 
 		 501 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  37.1 
 
 		 400 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  38.41 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  37.54 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  41.84 
 
 		 512 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  34.95 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  37.34 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  40.69 
 
 		 402 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  41.19 
 
 		 411 aa  182  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  43.1 
 
 		 412 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  40.69 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  40.07 
 
 		 515 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  34.58 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  40.58 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  38.8 
 
 		 411 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  38.1 
 
 		 520 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  38.83 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  38.22 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  38.78 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  40.19 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  38.62 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  33.23 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  39.19 
 
 		 501 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0008  hypothetical protein  35.44 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2325  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.58 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  38.41 
 
 		 503 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  35.44 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  38.13 
 
 		 514 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  38.46 
 
 		 507 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  35.25 
 
 		 507 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  33.97 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.73 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  37.23 
 
 		 408 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 404 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0037  hypothetical protein  34.98 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  40.6 
 
 		 523 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  39.73 
 
 		 510 aa  176  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  41.56 
 
 		 410 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  41.36 
 
 		 522 aa  176  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4110  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.81 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  38.06 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  40.26 
 
 		 403 aa  175  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  35.13 
 
 		 320 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>