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for query gene Smed_3633 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  51.4 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  51.92 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  51.92 
 
 		 218 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
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NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 225 aa  228  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  55.45 
 
 		 208 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  51.67 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  54.07 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  54.07 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  50 
 
 		 214 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
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NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  48.57 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  53.33 
 
 		 215 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  50 
 
 		 214 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  50 
 
 		 214 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  49.28 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  45.21 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  51 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  49.49 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  45.83 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  49.52 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  45.12 
 
 		 222 aa  204  9e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  46.89 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
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NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  46.98 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  47.47 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  47.83 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  47.55 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  45.89 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  47.34 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
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NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  44.28 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  44.6 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  48.76 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  44.6 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  44.6 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  44.6 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  44.6 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  44.13 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  44.44 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  44.44 
 
 		 215 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  44.44 
 
 		 215 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  44.44 
 
 		 215 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  44.44 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
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NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  45.37 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
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NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  43.13 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  41.23 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  39.23 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  40.28 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  40.51 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  37.62 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  37.56 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  39.71 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  39.71 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  39.23 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  39.23 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  39.23 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  39.23 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  39.23 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  39.23 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  38.97 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  36.02 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  38.28 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  38.43 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
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NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  38.76 
 
 		 213 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  39.04 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  36.45 
 
 		 212 aa  138  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  37.56 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  35.89 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3072  L-fuculose phosphate aldolase  45.45 
 
 		 152 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0460293  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  38.31 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  36.19 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  37.32 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  37.56 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  35.68 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
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NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  31.31 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  38.07 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  31.65 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.71 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  38.62 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  35.03 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  33.18 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.05 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  34.42 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
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NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  35.5 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  28.78 
 
 		 212 aa  106  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  35.42 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.43 
 
 		 212 aa  99.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5404  class II aldolase/adducin family protein  34.09 
 
 		 220 aa  98.2  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  30.77 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
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NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.47 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  31 
 
 		 207 aa  95.5  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
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NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  32.42 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  31.92 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
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NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  32.53 
 
 		 189 aa  93.2  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  31.96 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  34.4 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  30.85 
 
 		 753 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.83 
 
 		 214 aa  88.6  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  29.61 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  28.51 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  25.24 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  29.02 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
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