144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3250 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  100 
 
 		 161 aa  316  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  47.22 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  49.3 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  45.8 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  45.71 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  39.71 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  33.99 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  48.81 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  48.72 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  45.53 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  40.17 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  43.33 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  36.8 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  35.66 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  43.09 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  35.96 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  38.93 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  33.57 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  45.12 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  37.16 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  39.17 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  32.87 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  32.61 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  32.61 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  42.39 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1619  HPr kinase/phosphorylase  40.66 
 
 		 328 aa  61.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.984751 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0747  HPr kinase  34.78 
 
 		 282 aa  60.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.659883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  35.42 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1914  HPr kinase/phosphorylase  40.66 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  36 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  39.39 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4611  HPr kinase/phosphorylase  39.53 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  33.79 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  40.91 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  39.56 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  39.56 
 
 		 323 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  33.67 
 
 		 310 aa  57.8  0.00000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  39.56 
 
 		 323 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  39.56 
 
 		 324 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  39.56 
 
 		 324 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  42.86 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0521  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  39.53 
 
 		 330 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  38.82 
 
 		 319 aa  57.4  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0757  HPr kinase/phosphorylase  30.77 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.825604  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1208  HPr kinase/phosphorylase  30.77 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2805  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 352 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  38.37 
 
 		 316 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2712  HPr kinase/phosphorylase  39.77 
 
 		 340 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0752  HPr kinase/phosphorylase  42.68 
 
 		 316 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0947007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0473  HPr kinase/phosphorylase  43.75 
 
 		 325 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  42.05 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  42.05 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  42.05 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  42.05 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  42.05 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0082  HPr kinase/phosphorylase  40.86 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  42.05 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  42.05 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  42.68 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0405  HPr kinase/phosphorylase  40.96 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  39.76 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  42.05 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  40.96 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  42.05 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  42.05 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  43.37 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  39.76 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  40.24 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  39.76 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  31.65 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  31.65 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  32.48 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  39.53 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  42.05 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  42.53 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  33.33 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  42.17 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  39.29 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  32.94 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  35.16 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  33.61 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2617  HPr kinase  37.5 
 
 		 605 aa  53.9  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00751304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 319 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0224  HPr kinase/phosphorylase  39.76 
 
 		 318 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.395808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>