264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2058 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  100 
 
 
238 aa  473  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  65.69 
 
 
243 aa  320  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  64.85 
 
 
243 aa  314  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  62.5 
 
 
240 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  55.71 
 
 
241 aa  251  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  62.67 
 
 
236 aa  249  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  37.5 
 
 
239 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  31.91 
 
 
246 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  31.49 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  37.91 
 
 
234 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  35.35 
 
 
248 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  37.57 
 
 
258 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  32.9 
 
 
246 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  34.36 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  35.03 
 
 
242 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  31.58 
 
 
240 aa  104  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  33.18 
 
 
242 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  35.05 
 
 
240 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  38.79 
 
 
217 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  31.7 
 
 
243 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  30.36 
 
 
245 aa  101  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  31.68 
 
 
244 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  29.69 
 
 
282 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  29.36 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  29.46 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  28.64 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  36.65 
 
 
313 aa  97.1  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  31.4 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  30.4 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  32.64 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  31.75 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  31.82 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  31.75 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  31.75 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  30.53 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  32.12 
 
 
228 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  26.43 
 
 
236 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  32.61 
 
 
242 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4811  AzlC-like  29.02 
 
 
244 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278512  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4160  AzlC family protein  29.02 
 
 
244 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3356  AzlC family protein  29.02 
 
 
244 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  33.15 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  29.68 
 
 
250 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  30.29 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  30.29 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  32.88 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  29.96 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  30.86 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  31.25 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  30.29 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  30.29 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  30.29 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  33.88 
 
 
233 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  30.29 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  30.29 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  27.8 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  30.29 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  25.33 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  30.46 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  27.59 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  32.98 
 
 
307 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  27.8 
 
 
253 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  32.18 
 
 
247 aa  91.7  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  32 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2349  AzlC family protein  28.57 
 
 
246 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  35.14 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  33.14 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  31.22 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  31.89 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  31.16 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  30.67 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  30.11 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  29.61 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  30.41 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  34.02 
 
 
237 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  29.68 
 
 
245 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  30.08 
 
 
248 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  29.18 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  28.93 
 
 
285 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  29.48 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  27.19 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  32.2 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  29.48 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  30.48 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  28.86 
 
 
273 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  32.97 
 
 
250 aa  86.3  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1824  AzlC-like  29.68 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  29.75 
 
 
257 aa  85.9  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  28.86 
 
 
273 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  29.75 
 
 
257 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  28.93 
 
 
273 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  29.75 
 
 
257 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  27.73 
 
 
255 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  30.16 
 
 
286 aa  85.1  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  30.61 
 
 
245 aa  85.1  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  29.29 
 
 
293 aa  85.1  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  28.57 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  30.11 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  27.73 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2155  AzlC family protein  33.77 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.766728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>