36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0733 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 100 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1049  branched-chain amino acid transport  59.6 
 
 		 100 aa  93.2  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  39.08 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  40.86 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  37.23 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  40.23 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  37.23 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  41.05 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  40.86 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  40.86 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1825  branched chain amino acid ABC transporter  37.76 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  39.36 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  39.36 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  39.36 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1319  branched-chain amino acid transport  36.73 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  38.71 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  48.57 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2037  putative transmembrane protein  45 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  44.83 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4139  branched-chain amino acid transport  35.71 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0321  hypothetical protein  40.86 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0696  branched-chain amino acid transport  33 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4738  branched-chain amino acid transport  37.76 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  42.86 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  35.11 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4161  branched-chain amino acid transport  41.94 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.650904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3355  branched-chain amino acid transport  41.94 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.929099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4812  branched-chain amino acid transport  41.94 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  38.78 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  30.43 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2570  branched-chain amino acid transport  36.08 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.954298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2831  branched-chain amino acid transport  38.75 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547896  normal  0.0691317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2057  branched-chain amino acid transport  39.56 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960504  normal  0.0625464 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1757  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000052  putative transmembrane protein  39.44 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.323073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>