26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3748 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 98 aa  190  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  72.16 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  72.16 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  69.07 
 
 		 102 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  68.37 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  68.37 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  68.37 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  71.58 
 
 		 100 aa  135  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  68.04 
 
 		 99 aa  133  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0321  hypothetical protein  69.07 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  64.52 
 
 		 99 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  61.05 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4812  branched-chain amino acid transport  72.34 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195628  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3355  branched-chain amino acid transport  72.34 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.929099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4161  branched-chain amino acid transport  72.34 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.650904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  59.78 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  59.78 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  52.58 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1049  branched-chain amino acid transport  39.24 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  39.08 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  33.73 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  34.34 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  36.84 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2057  branched-chain amino acid transport  32.32 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960504  normal  0.0625464 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1757  branched-chain amino acid transport  30.53 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>