30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3947 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
99 aa  191  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  86.87 
 
 
99 aa  170  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  86.87 
 
 
99 aa  170  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  74.75 
 
 
104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  68.69 
 
 
100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  68.69 
 
 
100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  68.69 
 
 
100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  70.97 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  68.82 
 
 
100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  68.82 
 
 
100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  68.69 
 
 
99 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  64.52 
 
 
98 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  64.95 
 
 
100 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0321  hypothetical protein  69.7 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3355  branched-chain amino acid transport  70.97 
 
 
102 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.929099  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4161  branched-chain amino acid transport  70.97 
 
 
102 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.650904  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4812  branched-chain amino acid transport  70.97 
 
 
102 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  57.14 
 
 
100 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  38.46 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  35.53 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0696  branched-chain amino acid transport  34.21 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  40.23 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  28.57 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0574  branched-chain amino acid transport  32.58 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1049  branched-chain amino acid transport  38.89 
 
 
100 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2057  branched-chain amino acid transport  34.44 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960504  normal  0.0625464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  44.26 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1757  branched-chain amino acid transport  32.93 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2831  branched-chain amino acid transport  36.67 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547896  normal  0.0691317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2570  branched-chain amino acid transport  35 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.954298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>