28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1995 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
101 aa  194  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1757  branched-chain amino acid transport  66.67 
 
 
98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  48.24 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2057  branched-chain amino acid transport  39.36 
 
 
102 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960504  normal  0.0625464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2831  branched-chain amino acid transport  61.9 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547896  normal  0.0691317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2570  branched-chain amino acid transport  61.9 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.954298  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  34.34 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  44.26 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  44.83 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0321  hypothetical protein  41.27 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  48.15 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  40.91 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  37.68 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  37.68 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2876  branched-chain amino acid transport  38.18 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0584958  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000052  putative transmembrane protein  42.47 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.323073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  40.58 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  37.68 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  44.26 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  44.26 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  40 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  40 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  40 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  38.89 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1319  branched-chain amino acid transport  34.57 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  31.82 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1118  branched-chain amino acid transport  40.32 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>