28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2853 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2057  branched-chain amino acid transport  60.44 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960504  normal  0.0625464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2831  branched-chain amino acid transport  59.55 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547896  normal  0.0691317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2570  branched-chain amino acid transport  54.64 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.954298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1757  branched-chain amino acid transport  46.88 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  47.31 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  37.76 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  37.76 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  42.17 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  35.05 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  36.08 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  36.08 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0321  hypothetical protein  35.64 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  31.25 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  31.25 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  31.25 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  33.72 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0574  branched-chain amino acid transport  35.71 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  37.89 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  39.34 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  38.71 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4812  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195628  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4161  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.650904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3355  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.929099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  38.78 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>