27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3355 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4812  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 102 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195628  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3355  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 102 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.929099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4161  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 102 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.650904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  93.14 
 
 		 102 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  94.95 
 
 		 100 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  94.95 
 
 		 100 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  85.86 
 
 		 99 aa  167  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  80.41 
 
 		 100 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  80.41 
 
 		 100 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  80.41 
 
 		 100 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0321  hypothetical protein  83.51 
 
 		 100 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  72.34 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  70.83 
 
 		 100 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  70.97 
 
 		 99 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  65.66 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  68.13 
 
 		 99 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  68.13 
 
 		 99 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  55.21 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1049  branched-chain amino acid transport  40.86 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  34.94 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  29.79 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  41.94 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2057  branched-chain amino acid transport  34.44 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960504  normal  0.0625464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  41.54 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2831  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547896  normal  0.0691317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2570  branched-chain amino acid transport  38.33 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.954298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>