29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1049 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1049  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
100 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  59.6 
 
 
100 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  39.78 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  37.23 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  40.86 
 
 
100 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  40.86 
 
 
100 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  35.11 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  35.11 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  35.11 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  38.3 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  36.56 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  38.3 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  38.89 
 
 
104 aa  53.9  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  37.78 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  36.78 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0696  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  35.11 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  34.69 
 
 
105 aa  48.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  44.83 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0321  hypothetical protein  38.71 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1757  branched-chain amino acid transport  39.13 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4161  branched-chain amino acid transport  40.86 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.650904  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3355  branched-chain amino acid transport  40.86 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.929099  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4812  branched-chain amino acid transport  40.86 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2831  branched-chain amino acid transport  44.44 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547896  normal  0.0691317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2570  branched-chain amino acid transport  44.44 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.954298  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1825  branched chain amino acid ABC transporter  34.34 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2037  putative transmembrane protein  36.99 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485206  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0574  branched-chain amino acid transport  33.67 
 
 
106 aa  40  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>