24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1764 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 101 aa  188  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1319  branched-chain amino acid transport  43.75 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1825  branched chain amino acid ABC transporter  43.75 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4139  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4738  branched-chain amino acid transport  41.3 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2037  putative transmembrane protein  49.23 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000052  putative transmembrane protein  50 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.323073  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  33 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  44.05 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  44.83 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  36.56 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  29.29 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  35.71 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0696  branched-chain amino acid transport  34 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  35.71 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  35.71 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  34.38 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  35.48 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2876  branched-chain amino acid transport  35.38 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0584958  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  36.49 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1118  branched-chain amino acid transport  38.1 
 
 		 106 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>