36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3354 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
103 aa  189  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0696  branched-chain amino acid transport  56.57 
 
 
104 aa  113  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  55.56 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0574  branched-chain amino acid transport  52.08 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1825  branched chain amino acid ABC transporter  33.72 
 
 
105 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4139  branched-chain amino acid transport  31.4 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  30.61 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  30.61 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4738  branched-chain amino acid transport  46 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1319  branched-chain amino acid transport  32.47 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  32.35 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  28.57 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  32.35 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  32.35 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  32.35 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  29.17 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  29.17 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  33.93 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  27.08 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  27.08 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2876  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0584958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1388  branched-chain amino acid transport  32.98 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000854559  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  28.42 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  31.63 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  27.08 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  29.47 
 
 
104 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2894  branched-chain amino acid transport  30.21 
 
 
103 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24933e-22 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  31.82 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  39.34 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4812  branched-chain amino acid transport  30 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195628  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3355  branched-chain amino acid transport  30 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.929099  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4161  branched-chain amino acid transport  30 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.650904  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000052  putative transmembrane protein  29.17 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.323073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  30.16 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1118  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 
106 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>