14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1118 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1118  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 106 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2156  branched-chain amino acid transport  84.91 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1319  branched-chain amino acid transport  45.63 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1825  branched chain amino acid ABC transporter  43.01 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4139  branched-chain amino acid transport  39.78 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4738  branched-chain amino acid transport  39.78 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  40.66 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  36.89 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2894  branched-chain amino acid transport  41.05 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24933e-22 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  40.22 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1388  branched-chain amino acid transport  41.76 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000854559  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0574  branched-chain amino acid transport  47.62 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  39.13 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000052  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.323073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>