25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02083 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  191  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  73.47 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  73.47 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  73.47 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  72.92 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  72.92 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  73.96 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  72.45 
 
 		 99 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  71.58 
 
 		 98 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0321  hypothetical protein  71.43 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  63.54 
 
 		 104 aa  120  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  64.95 
 
 		 99 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4161  branched-chain amino acid transport  70.83 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.650904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3355  branched-chain amino acid transport  70.83 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.929099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4812  branched-chain amino acid transport  70.83 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  58 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  60.82 
 
 		 99 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  60.82 
 
 		 99 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  35.8 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1049  branched-chain amino acid transport  36.71 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2057  branched-chain amino acid transport  33.72 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960504  normal  0.0625464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  48.15 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  35.11 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  38.6 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  28.42 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>