25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2223 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 104 aa  203  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  74.75 
 
 		 99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  66.67 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  66.67 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  66.67 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  71.74 
 
 		 99 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  71.74 
 
 		 99 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  65.98 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  63.64 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  63.64 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  66.67 
 
 		 99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  63.54 
 
 		 100 aa  120  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  61.05 
 
 		 98 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0321  hypothetical protein  67.37 
 
 		 100 aa  114  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3355  branched-chain amino acid transport  65.66 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.929099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4812  branched-chain amino acid transport  65.66 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195628  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4161  branched-chain amino acid transport  65.66 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.650904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  54.08 
 
 		 100 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1049  branched-chain amino acid transport  37.97 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  36.14 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2057  branched-chain amino acid transport  29.9 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960504  normal  0.0625464 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  34.48 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  29.47 
 
 		 103 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  38.89 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  38.89 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>