29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3276 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 100 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 100 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  94.95 
 
 		 102 aa  182  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  87.88 
 
 		 99 aa  173  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  80.41 
 
 		 100 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4812  branched-chain amino acid transport  94.95 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195628  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3355  branched-chain amino acid transport  94.95 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.929099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  80.41 
 
 		 100 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  80.41 
 
 		 100 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4161  branched-chain amino acid transport  94.95 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.650904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0321  hypothetical protein  83.51 
 
 		 100 aa  140  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  72.92 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  72.16 
 
 		 98 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  68.82 
 
 		 99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2223  branched-chain amino acid transport  63.64 
 
 		 104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.877315  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  65.93 
 
 		 99 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  65.93 
 
 		 99 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  56.25 
 
 		 100 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1049  branched-chain amino acid transport  40.86 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2057  branched-chain amino acid transport  36.67 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960504  normal  0.0625464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  36.14 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  40.86 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  29.17 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2831  branched-chain amino acid transport  32.5 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547896  normal  0.0691317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2570  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.954298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0696  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>