25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2570 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2570  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
102 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.954298  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2831  branched-chain amino acid transport  95.1 
 
 
102 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547896  normal  0.0691317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2057  branched-chain amino acid transport  60.64 
 
 
102 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960504  normal  0.0625464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2853  hypothetical protein  54.64 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1757  branched-chain amino acid transport  41.57 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  55.56 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  39.74 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  39.74 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0363  AzlD family protein  29.29 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0376  AzlD family protein  29.29 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  44.44 
 
 
100 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0553  hypothetical protein  29.29 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  31.91 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  29.59 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  35.62 
 
 
99 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  31.03 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0321  hypothetical protein  39.29 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  31.03 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  35 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4161  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.650904  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5231  branched-chain amino acid transport  28.57 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120117  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3355  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.929099  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4812  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1049  branched-chain amino acid transport  44.44 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_003296  RS02083  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>