20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0696 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0696  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 104 aa  190  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2666  branched-chain amino acid transport  72.12 
 
 		 105 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404817  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  56.57 
 
 		 103 aa  113  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0574  branched-chain amino acid transport  51.04 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1825  branched chain amino acid ABC transporter  36.89 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1319  branched-chain amino acid transport  35.92 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4139  branched-chain amino acid transport  35.11 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0725  hypothetical protein  38.1 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0775  hypothetical protein  38.1 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4738  branched-chain amino acid transport  37.23 
 
 		 105 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  34.21 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  35.71 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  33 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3170  branched-chain amino acid transport  34.92 
 
 		 100 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1049  branched-chain amino acid transport  33.75 
 
 		 100 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1388  branched-chain amino acid transport  35.82 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000854559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2901  hypothetical protein  30.1 
 
 		 102 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3276  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849738  normal  0.866175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5134  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797346  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2894  branched-chain amino acid transport  34.33 
 
 		 103 aa  40  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24933e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>