40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0621 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 220 aa  437  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  70.77 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  65.38 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  59.52 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  54.21 
 
 		 214 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  37.99 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  50.45 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  37.78 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  35.56 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  35.56 
 
 		 275 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  34.81 
 
 		 283 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  34.94 
 
 		 589 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  36.3 
 
 		 312 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  36.3 
 
 		 312 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  38.64 
 
 		 311 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  35.56 
 
 		 301 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  37.21 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  36.09 
 
 		 316 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  34.62 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  41.41 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0052  SH3 type 3 domain-containing protein  35.45 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  30.56 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  32.11 
 
 		 193 aa  62  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  34.02 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  31.03 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  34.62 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  33.65 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  44.44 
 
 		 100 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  30.17 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  39.29 
 
 		 167 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  37.1 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  37.1 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  28.72 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0726  SH3 type 3 domain protein  30.61 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 382 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.3 
 
 		 472 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.22 
 
 		 476 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>