More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0179 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1070    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3820  hypothetical protein  53.15 
 
 		 522 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366241  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3213  hypothetical protein  51.99 
 
 		 523 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  51.02 
 
 		 530 aa  478  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1394  hypothetical protein  50.09 
 
 		 545 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  49.08 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6721  hypothetical protein  53.23 
 
 		 564 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4418  hypothetical protein  50.09 
 
 		 545 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4329  hypothetical protein  49.72 
 
 		 545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  49.16 
 
 		 545 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1035  hypothetical protein  48.51 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0749  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  51.14 
 
 		 546 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  49.63 
 
 		 533 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1549  hypothetical protein  44.3 
 
 		 580 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  47.89 
 
 		 576 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3922  hypothetical protein  49.63 
 
 		 533 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  49.15 
 
 		 544 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  43.42 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  42.86 
 
 		 535 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5710  hypothetical protein  43.45 
 
 		 536 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65795  hypothetical protein  43.02 
 
 		 559 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000547463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  38.09 
 
 		 534 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.45 
 
 		 554 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2951  thiamine pyrophosphate protein central region  38.87 
 
 		 536 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103515  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1583  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  40.23 
 
 		 536 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4034  thiamine pyrophosphate protein central region  35.32 
 
 		 541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.350713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  34.43 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  33.81 
 
 		 578 aa  246  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  32.84 
 
 		 562 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  33.02 
 
 		 562 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  33.02 
 
 		 562 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  32.84 
 
 		 562 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.84 
 
 		 562 aa  243  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  32.84 
 
 		 562 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  33.02 
 
 		 562 aa  243  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  33.51 
 
 		 541 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  34.38 
 
 		 543 aa  242  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  32.84 
 
 		 562 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  33.09 
 
 		 562 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  33.39 
 
 		 558 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  32.32 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  32.65 
 
 		 562 aa  236  7e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  32.28 
 
 		 562 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  32.28 
 
 		 562 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  32.28 
 
 		 562 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  32.28 
 
 		 562 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  34.99 
 
 		 564 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  32.28 
 
 		 562 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.07 
 
 		 569 aa  233  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  34.07 
 
 		 554 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  32.72 
 
 		 569 aa  229  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  32.4 
 
 		 554 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  30.78 
 
 		 623 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.08 
 
 		 557 aa  226  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  33.27 
 
 		 554 aa  226  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.75 
 
 		 587 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.83 
 
 		 558 aa  223  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  32.03 
 
 		 547 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  30.09 
 
 		 577 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  29.91 
 
 		 622 aa  219  7e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  33.27 
 
 		 564 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.09 
 
 		 573 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.21 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  30.58 
 
 		 574 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.41 
 
 		 619 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.46 
 
 		 574 aa  216  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  29.4 
 
 		 578 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.86 
 
 		 593 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.05 
 
 		 636 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.57 
 
 		 586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0611  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.64 
 
 		 589 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.175913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.67 
 
 		 581 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  33.89 
 
 		 563 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.49 
 
 		 563 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.81 
 
 		 557 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30090  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  33.39 
 
 		 553 aa  213  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.492934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  31.3 
 
 		 554 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.69 
 
 		 602 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.15 
 
 		 555 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 600 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.67 
 
 		 573 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.88 
 
 		 586 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  29.09 
 
 		 573 aa  207  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  32.16 
 
 		 595 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.16 
 
 		 595 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.16 
 
 		 595 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  32.04 
 
 		 605 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.68 
 
 		 563 aa  207  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  31.3 
 
 		 541 aa  207  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.96 
 
 		 573 aa  206  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  29.24 
 
 		 566 aa  206  6e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.47 
 
 		 570 aa  206  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.09 
 
 		 573 aa  206  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.26 
 
 		 557 aa  206  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.11 
 
 		 561 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4300  hypothetical protein  34.2 
 
 		 569 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.94 
 
 		 612 aa  206  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  28 
 
 		 545 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.25 
 
 		 574 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>