61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3658 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  100 
 
 
444 aa  868    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5538  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  59.81 
 
 
451 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0008  dual specificity protein phosphatase  58.96 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.851139  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  59 
 
 
449 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  58.47 
 
 
437 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  53.68 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2884  Dual specificity protein phosphatase  46.21 
 
 
437 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.170107  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  47.65 
 
 
464 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  49.41 
 
 
468 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2877  putative phosphatase protein  48.15 
 
 
447 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510949  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  49.04 
 
 
471 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  48.57 
 
 
471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  48.57 
 
 
471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  50.24 
 
 
467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  49.28 
 
 
467 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  44.1 
 
 
439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  44.1 
 
 
439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  43.87 
 
 
439 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  44.53 
 
 
430 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  44.78 
 
 
430 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  44.53 
 
 
438 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  44.53 
 
 
430 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  44.53 
 
 
430 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  44.53 
 
 
430 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  43.92 
 
 
428 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  42.93 
 
 
430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  44.16 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  44.16 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  42.37 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.92 
 
 
478 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02972  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  68.46 
 
 
132 aa  180  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  38.21 
 
 
246 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  28.86 
 
 
540 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  29.18 
 
 
552 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  26.36 
 
 
560 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  26.96 
 
 
563 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  28.02 
 
 
568 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  29.66 
 
 
565 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  27.51 
 
 
545 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  26.96 
 
 
563 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  26.96 
 
 
563 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  29.7 
 
 
565 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  29.21 
 
 
565 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  27.5 
 
 
533 aa  60.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  26.21 
 
 
550 aa  57.4  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.41 
 
 
217 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  27.06 
 
 
581 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.75 
 
 
217 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  30.87 
 
 
463 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.84 
 
 
202 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  25 
 
 
547 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  28.5 
 
 
206 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_003296  RS00861  hypothetical protein  29.87 
 
 
220 aa  47.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2121  Ser/Thr and Tyr protein phosphatase (dual specificity)#  29.03 
 
 
240 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000187459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4862  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.85 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5140  PAP2 family protein  28.02 
 
 
215 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000194372  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35464  predicted protein  31.3 
 
 
196 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4721  PAP2 family protein  27.47 
 
 
215 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00298694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5104  PAP2 family protein  29.17 
 
 
215 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5133  PAP2 family protein  29.17 
 
 
215 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000713606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4706  PAP2 family protein  29.17 
 
 
215 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0195137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>