More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2080 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2080  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 825 aa  1701    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646014  normal  0.992336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2018  MCP methyltransferase, CheR-type  60.49 
 
 		 865 aa  1016    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1244  hypothetical protein  37.11 
 
 		 514 aa  296  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.635115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2779  hypothetical protein  36.82 
 
 		 507 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05314  conserved hypothetical protein  31.38 
 
 		 529 aa  170  9e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01637  Molybdenum cofactor sulfurase (MoCo sulfurase)(MOS)(EC 4.4.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9UV64]  30.52 
 
 		 839 aa  157  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46641  predicted protein  27.24 
 
 		 1036 aa  133  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.87 
 
 		 413 aa  109  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.87 
 
 		 413 aa  109  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.76 
 
 		 417 aa  108  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.17 
 
 		 429 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.88 
 
 		 412 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.33 
 
 		 414 aa  106  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.37 
 
 		 608 aa  105  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.81 
 
 		 414 aa  104  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.42 
 
 		 413 aa  103  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.4 
 
 		 415 aa  102  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  24.6 
 
 		 413 aa  101  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.61 
 
 		 428 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.15 
 
 		 414 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.55 
 
 		 415 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.36 
 
 		 413 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.15 
 
 		 429 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.65 
 
 		 419 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.15 
 
 		 429 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.68 
 
 		 408 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.88 
 
 		 406 aa  99.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  26.86 
 
 		 421 aa  99.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  27.35 
 
 		 414 aa  100  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.65 
 
 		 419 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.32 
 
 		 414 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.93 
 
 		 407 aa  99.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.93 
 
 		 414 aa  99  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  27.27 
 
 		 416 aa  98.6  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.18 
 
 		 408 aa  98.6  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  27.43 
 
 		 414 aa  98.2  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.82 
 
 		 414 aa  98.2  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.4 
 
 		 407 aa  97.4  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.74 
 
 		 417 aa  97.8  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.33 
 
 		 425 aa  97.4  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.74 
 
 		 413 aa  97.8  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  28.38 
 
 		 403 aa  97.8  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.61 
 
 		 429 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.06 
 
 		 419 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.35 
 
 		 406 aa  96.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.75 
 
 		 443 aa  96.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.75 
 
 		 413 aa  96.3  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  28.32 
 
 		 425 aa  96.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.01 
 
 		 425 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.5 
 
 		 413 aa  96.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.81 
 
 		 415 aa  95.9  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.91 
 
 		 420 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.12 
 
 		 413 aa  95.5  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  27.35 
 
 		 452 aa  95.5  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.74 
 
 		 610 aa  95.1  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.36 
 
 		 426 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.2 
 
 		 421 aa  94.4  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.2 
 
 		 644 aa  94.4  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  25.92 
 
 		 429 aa  94  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  24.53 
 
 		 406 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  24.53 
 
 		 406 aa  93.6  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  24.53 
 
 		 406 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.26 
 
 		 409 aa  94  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  24.53 
 
 		 406 aa  93.6  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.61 
 
 		 406 aa  94  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  27.52 
 
 		 399 aa  94  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.49 
 
 		 403 aa  93.6  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.27 
 
 		 415 aa  94  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.8 
 
 		 417 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.94 
 
 		 630 aa  92.8  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  24.38 
 
 		 666 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.59 
 
 		 442 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  25.2 
 
 		 665 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.97 
 
 		 413 aa  92.4  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.37 
 
 		 650 aa  92.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  24.27 
 
 		 406 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.11 
 
 		 414 aa  92.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  24.27 
 
 		 406 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.08 
 
 		 418 aa  92  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  24.27 
 
 		 406 aa  92  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.15 
 
 		 414 aa  92  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.47 
 
 		 410 aa  92  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  24.27 
 
 		 406 aa  91.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  24.27 
 
 		 406 aa  91.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.08 
 
 		 418 aa  91.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  26.34 
 
 		 415 aa  91.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.27 
 
 		 406 aa  91.3  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  26.27 
 
 		 414 aa  91.3  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.19 
 
 		 420 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.27 
 
 		 406 aa  91.3  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  28.74 
 
 		 420 aa  90.9  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  27.89 
 
 		 417 aa  90.9  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.6 
 
 		 605 aa  91.3  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  26.68 
 
 		 414 aa  90.5  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.57 
 
 		 408 aa  90.5  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  25.55 
 
 		 896 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.86 
 
 		 404 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2996  cysteine sulfinate desulfinase  28.42 
 
 		 401 aa  90.1  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  24.62 
 
 		 682 aa  90.5  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  26.27 
 
 		 414 aa  89.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>