More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4890 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 122 aa  246  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  71.31 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  61.11 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  59.35 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 125 aa  143  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  51.56 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 125 aa  134  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 131 aa  130  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 143 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 127 aa  129  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  48.44 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  47.5 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  46.09 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  50.41 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  46.34 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 227 aa  123  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  48.78 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  46.28 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  46.28 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  48.78 
 
 		 125 aa  119  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  48.36 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 125 aa  119  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 130 aa  119  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  48.41 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  46.77 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  44.44 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  44 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  50 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  43.65 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>