30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2536 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  100 
 
 
741 aa  1520    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  58.22 
 
 
725 aa  862    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  29.38 
 
 
785 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  26.15 
 
 
735 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  26.36 
 
 
735 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  31.37 
 
 
824 aa  173  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  33.72 
 
 
841 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  27.75 
 
 
881 aa  151  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  28.78 
 
 
877 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  28.92 
 
 
892 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  30.59 
 
 
872 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  30.77 
 
 
873 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  31.05 
 
 
873 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  29.84 
 
 
868 aa  144  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  28.74 
 
 
936 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  28.6 
 
 
808 aa  140  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  24.54 
 
 
790 aa  124  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  25.27 
 
 
803 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  25.14 
 
 
778 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  26.9 
 
 
810 aa  115  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  23.42 
 
 
799 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  23.42 
 
 
799 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  23.82 
 
 
799 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  23.34 
 
 
788 aa  99.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  22.11 
 
 
793 aa  94.4  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  23.15 
 
 
761 aa  75.1  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  30.11 
 
 
379 aa  61.6  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  30.48 
 
 
356 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  26.19 
 
 
369 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4864  hypothetical protein  26.11 
 
 
236 aa  50.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>