28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2455 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  100 
 
 		 628 aa  1298    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  56.89 
 
 		 626 aa  774    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  51.04 
 
 		 629 aa  668    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  44.08 
 
 		 847 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  34.71 
 
 		 1194 aa  359  9e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  33.75 
 
 		 618 aa  270  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  29.12 
 
 		 624 aa  266  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.74 
 
 		 1246 aa  265  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03380  expressed protein  26.4 
 
 		 843 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  28.83 
 
 		 628 aa  97.4  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  24.37 
 
 		 581 aa  73.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2894  heparinase II/III family protein  24.14 
 
 		 694 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  23.94 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  22.73 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  21.23 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  21.62 
 
 		 646 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  22.41 
 
 		 637 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  22.64 
 
 		 601 aa  55.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  21.63 
 
 		 597 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0488  heparinase II/III family protein  20.36 
 
 		 761 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  22.68 
 
 		 645 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  22.22 
 
 		 649 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  23.28 
 
 		 1200 aa  48.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  22.95 
 
 		 644 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3284  hypothetical protein  22.24 
 
 		 736 aa  47.4  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.924939  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  22.39 
 
 		 649 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1166  Heparinase II/III family protein  20.16 
 
 		 741 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.307073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  26.45 
 
 		 623 aa  43.9  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>