49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1861 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3230  hypothetical protein  47.11 
 
 		 891 aa  830    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522879 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06286  conserved hypothetical protein  49.78 
 
 		 1036 aa  887    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931044  normal  0.440135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2401  hypothetical protein  52.71 
 
 		 911 aa  942    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.759091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  53.07 
 
 		 914 aa  953    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  51.8 
 
 		 913 aa  924    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7096  hypothetical protein  53.06 
 
 		 935 aa  954    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0399  hypothetical protein  53.28 
 
 		 915 aa  966    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  54.09 
 
 		 917 aa  946    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  53.35 
 
 		 913 aa  968    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4437  hypothetical protein  56.19 
 
 		 901 aa  1032    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.43496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  68.27 
 
 		 896 aa  1290    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6985  hypothetical protein  46.23 
 
 		 895 aa  797    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5810  hypothetical protein  55.15 
 
 		 881 aa  1002    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  hitchhiker  0.00193239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  47.16 
 
 		 887 aa  839    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6293  hypothetical protein  56.6 
 
 		 869 aa  1025    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0409  hypothetical protein  53.23 
 
 		 915 aa  964    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  41.79 
 
 		 912 aa  714    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1838  hypothetical protein  48.59 
 
 		 893 aa  846    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.307747  normal  0.469868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  51.23 
 
 		 896 aa  920    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  100 
 
 		 892 aa  1862    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  55.07 
 
 		 903 aa  1011    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2521  hypothetical protein  53.7 
 
 		 885 aa  946    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343872  normal  0.100285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1748  hypothetical protein  48.48 
 
 		 911 aa  824    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0575728  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1773  hypothetical protein  53.36 
 
 		 905 aa  964    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04580  cytoplasm protein, putative  51.91 
 
 		 1144 aa  647    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  57.95 
 
 		 886 aa  1061    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1825  hypothetical protein  47.3 
 
 		 897 aa  833    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0133367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  49.37 
 
 		 890 aa  873    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0671  hypothetical protein  46.83 
 
 		 901 aa  828    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.466888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  52.83 
 
 		 933 aa  942    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4080  hypothetical protein  53.47 
 
 		 912 aa  952    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2813  glucosidase  60.87 
 
 		 881 aa  1149    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.125423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3432  glucosidase  57.35 
 
 		 883 aa  1071    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1943  hypothetical protein  55.1 
 
 		 891 aa  1024    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637433  normal  0.041134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0673  hypothetical protein  52.75 
 
 		 910 aa  936    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0857899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0406  hypothetical protein  53.48 
 
 		 919 aa  956    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87266  conserved hypothetical protein  49.49 
 
 		 1047 aa  905    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483888  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2632  hypothetical protein  52.04 
 
 		 921 aa  931    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  48.64 
 
 		 901 aa  814    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3385  hypothetical protein  51.93 
 
 		 890 aa  957    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0706228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  30.58 
 
 		 708 aa  59.7  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  22.73 
 
 		 721 aa  52  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  21.94 
 
 		 732 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  22.33 
 
 		 717 aa  48.5  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  23.1 
 
 		 852 aa  48.1  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  23.11 
 
 		 543 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  23.56 
 
 		 681 aa  44.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 		 718 aa  44.3  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  23.86 
 
 		 749 aa  44.3  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>