247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1449 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
254 aa  500  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  51.59 
 
 
255 aa  242  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  45.83 
 
 
252 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  43.09 
 
 
253 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  42.68 
 
 
276 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  42.74 
 
 
253 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  43.15 
 
 
253 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  41.84 
 
 
252 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  41.84 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  43.1 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  40.8 
 
 
254 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  42.86 
 
 
251 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  40.57 
 
 
263 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  43.25 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  42.68 
 
 
252 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  42.98 
 
 
259 aa  178  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  41.46 
 
 
252 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  41.7 
 
 
252 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 
252 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  39.84 
 
 
252 aa  174  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  42.68 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  40.76 
 
 
252 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  40.59 
 
 
253 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  41.3 
 
 
252 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  41.49 
 
 
253 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  36.9 
 
 
264 aa  164  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  36.97 
 
 
260 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  41.28 
 
 
253 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  39.42 
 
 
286 aa  158  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  38.33 
 
 
262 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  39.13 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  36.86 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  37.85 
 
 
255 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 
264 aa  148  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  34.11 
 
 
255 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  33.59 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  33.59 
 
 
256 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  34.88 
 
 
255 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  34.88 
 
 
255 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  33.98 
 
 
256 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  36.95 
 
 
254 aa  145  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  33.59 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  33.59 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  33.59 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  33.59 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  35.55 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  36.48 
 
 
256 aa  144  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  36.48 
 
 
256 aa  144  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  34.11 
 
 
255 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  33.72 
 
 
255 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  33.72 
 
 
255 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  35.29 
 
 
254 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  37.33 
 
 
256 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  34.48 
 
 
256 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  33.59 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  33.72 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  34.48 
 
 
256 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  34.5 
 
 
255 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  34.31 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0959  hypothetical protein  39.62 
 
 
259 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  34.11 
 
 
255 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  34.11 
 
 
255 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  35.44 
 
 
251 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  33.88 
 
 
266 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  33.87 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  38.21 
 
 
253 aa  135  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  34.73 
 
 
268 aa  132  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  34.73 
 
 
268 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  34.73 
 
 
268 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  34.9 
 
 
253 aa  131  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  36.68 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  36.68 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  36.68 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  36.68 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  36.68 
 
 
256 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  36.68 
 
 
256 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  36.68 
 
 
256 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  36.24 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  34.18 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  32.8 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  37.55 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  36.16 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  34.47 
 
 
279 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  36.09 
 
 
267 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  36.71 
 
 
261 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  33.73 
 
 
253 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  31.47 
 
 
254 aa  125  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  33.07 
 
 
251 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  31.84 
 
 
254 aa  125  9e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  35.66 
 
 
261 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  32.94 
 
 
259 aa  125  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  32.67 
 
 
251 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  31.91 
 
 
264 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  31.47 
 
 
254 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  32.24 
 
 
270 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  35.07 
 
 
254 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  32.11 
 
 
262 aa  122  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2209  protein of unknown function DUF81  34.91 
 
 
255 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  31.43 
 
 
266 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  35.11 
 
 
268 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>