233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  347  5e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  44.75 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  50.63 
 
 
192 aa  127  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  120  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  43.67 
 
 
162 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  38.55 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  41.9 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  38.18 
 
 
160 aa  104  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  40.13 
 
 
166 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  39.58 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  42.04 
 
 
160 aa  92  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  41.18 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  40.62 
 
 
220 aa  89.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  40.62 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  40.94 
 
 
162 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  37.72 
 
 
220 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  38.6 
 
 
219 aa  84.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  33.13 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  37.5 
 
 
205 aa  80.9  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  37.04 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  40.85 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  36.76 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  38.31 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  31.9 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  30.77 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  35.19 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  36.84 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  41.98 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  30.38 
 
 
159 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  28.19 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  29.45 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  28.66 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  31.65 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  36.26 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  31.29 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  30.66 
 
 
138 aa  67  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  33.72 
 
 
203 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  27.85 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  44.86 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  40.23 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  40.12 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0133  hypothetical protein  26.09 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1491  hypothetical protein  24.82 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00182887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0173  hypothetical protein  27.97 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.961573  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  30.58 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  34.62 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1413  hypothetical protein  26.17 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000509228  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  27.81 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  39.08 
 
 
153 aa  63.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  31.54 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  26.8 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  29.94 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  32.14 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  34.97 
 
 
308 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  28.75 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  31.91 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  31.54 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0224  hypothetical protein  28.7 
 
 
140 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0370769  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  36.84 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  28.83 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  26.17 
 
 
153 aa  61.6  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  33.98 
 
 
152 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0151  hypothetical protein  26.27 
 
 
140 aa  61.2  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  29.52 
 
 
162 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  29.81 
 
 
171 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  34.76 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  34.76 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  34.76 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  29.81 
 
 
171 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  26.35 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  34.07 
 
 
157 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  31.93 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  32.23 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06980  hypothetical protein  41.28 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.106451  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0832  protein of unknown function DUF150  31 
 
 
164 aa  58.9  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000130104  hitchhiker  0.000000375903 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0250  protein of unknown function DUF150  32.32 
 
 
142 aa  58.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0813  hypothetical protein  33.87 
 
 
157 aa  58.2  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000388693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  28.48 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  30.56 
 
 
155 aa  58.2  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  28.75 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  29.19 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0736  hypothetical protein  32 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  35.85 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  40.35 
 
 
268 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  27.15 
 
 
152 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0810  hypothetical protein  28.83 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0615439  hitchhiker  0.00120973 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  29.01 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  27.66 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  28.74 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  28.74 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1359  hypothetical protein  28.43 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0045809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  34.29 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  30.1 
 
 
153 aa  55.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  33.85 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  31.78 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  30.36 
 
 
209 aa  55.1  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>