25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06130 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  48.95 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  46.61 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0059  hypothetical protein  46.47 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  43.46 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  35.56 
 
 		 233 aa  85.5  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  31.47 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  29.58 
 
 		 392 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 		 1505 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2270  hypothetical protein  29.78 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  30.3 
 
 		 217 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  29.32 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  28.29 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  30.3 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.45 
 
 		 1171 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  19.44 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.21 
 
 		 478 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  26.88 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  28.48 
 
 		 219 aa  45.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  25.34 
 
 		 1143 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  30.51 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  25.34 
 
 		 1182 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  25.56 
 
 		 213 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>