More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_04680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  100 
 
 
301 aa  595  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0411  NLPA lipoprotein  64.39 
 
 
300 aa  339  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580913  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2302  NLPA lipoprotein  49.34 
 
 
301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197407  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0249  NLPA lipoprotein  47.33 
 
 
304 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0699  metal ion ABC transporter periplasmic protein  49.81 
 
 
326 aa  242  5e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  44.41 
 
 
323 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4336  NLPA lipoprotein  46.79 
 
 
314 aa  228  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1651  NLPA lipoprotein  42.46 
 
 
291 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3651  NLPA lipoprotein  45.09 
 
 
316 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.31 
 
 
284 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.7 
 
 
284 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  38.49 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  37.93 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  37.93 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.93 
 
 
284 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.78 
 
 
280 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  38.78 
 
 
280 aa  175  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  39.02 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  37.13 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  35.66 
 
 
284 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  33.82 
 
 
286 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  34.83 
 
 
281 aa  155  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  36.98 
 
 
274 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3533  NLPA lipoprotein  34.2 
 
 
272 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.16791  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1597  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  33.81 
 
 
282 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.128331  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  34.48 
 
 
278 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  34.34 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  34.17 
 
 
266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  33.1 
 
 
278 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  36.02 
 
 
280 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  36.02 
 
 
280 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  36.75 
 
 
281 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  34.32 
 
 
276 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.67 
 
 
271 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.67 
 
 
271 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.67 
 
 
271 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.67 
 
 
271 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.67 
 
 
271 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  38.71 
 
 
257 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  37.09 
 
 
281 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  33.48 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  36.97 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.61 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  32.33 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.69 
 
 
271 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  34.67 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.67 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.67 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.61 
 
 
271 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  32.86 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.67 
 
 
271 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.61 
 
 
271 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  34.31 
 
 
271 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  34.31 
 
 
271 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.31 
 
 
271 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  34.96 
 
 
256 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.31 
 
 
271 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  31.27 
 
 
300 aa  138  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.31 
 
 
271 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.47 
 
 
271 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  33.46 
 
 
267 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  33.61 
 
 
300 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  33.46 
 
 
267 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  36.93 
 
 
272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  34.06 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  33.94 
 
 
271 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  36.4 
 
 
262 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.24 
 
 
282 aa  136  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  32.14 
 
 
284 aa  136  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.35 
 
 
272 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.35 
 
 
272 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.35 
 
 
272 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  37.35 
 
 
281 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.35 
 
 
272 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  35.44 
 
 
276 aa  136  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.35 
 
 
272 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  35.86 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.31 
 
 
271 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  35.94 
 
 
260 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  34.06 
 
 
272 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.31 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0971  protein of unknown function/lipoprotein, putative  31.32 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  35.55 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  35.55 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  33.45 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  32.08 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  35.16 
 
 
271 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  35.16 
 
 
271 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  35.16 
 
 
271 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  35.16 
 
 
271 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  36.41 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  34.47 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  36.61 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  34.47 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  35 
 
 
256 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  35.24 
 
 
279 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  36.68 
 
 
272 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  33.84 
 
 
278 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  35.19 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  35.15 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>