31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1538 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  82.74 
 
 		 390 aa  651    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  98.22 
 
 		 394 aa  802    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  816    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  97.46 
 
 		 394 aa  760    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  61.84 
 
 		 393 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  60.42 
 
 		 395 aa  481  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  58.58 
 
 		 411 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  53.97 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  48.73 
 
 		 911 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  49.01 
 
 		 882 aa  330  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  48.73 
 
 		 911 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  47.38 
 
 		 907 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  48.17 
 
 		 911 aa  326  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  45.07 
 
 		 884 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  43.7 
 
 		 883 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  43.09 
 
 		 880 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  36.96 
 
 		 367 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  38.63 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  38.58 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  37.66 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  36.65 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  35.6 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  35.07 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  34.01 
 
 		 383 aa  179  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  25.37 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  25 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  24.22 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  25.3 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  26.5 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  27.66 
 
 		 2172 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  32.41 
 
 		 924 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>