47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1541 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  100 
 
 		 79 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  98.73 
 
 		 79 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  96.2 
 
 		 79 aa  156  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  77.33 
 
 		 87 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  86.08 
 
 		 81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  73.61 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  71.62 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  74.65 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  73.24 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  68.57 
 
 		 78 aa  95.9  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  56.41 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  62.67 
 
 		 78 aa  94  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  59.46 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  58.67 
 
 		 79 aa  89.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  58.33 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  54.05 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  41.89 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  47.3 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  46.05 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  46.58 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  50 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  46.84 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  46.05 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  50.7 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  46.67 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  45.33 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  45.07 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  40.85 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  40.28 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  36.78 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  39.71 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  42.67 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  40.26 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.1 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  34.21 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  34.25 
 
 		 384 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  43.75 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  45.45 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  31.76 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 125 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  36.99 
 
 		 80 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  35.53 
 
 		 102 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>