25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3522 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  92.89 
 
 		 197 aa  345  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  92.39 
 
 		 197 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  76.65 
 
 		 197 aa  296  9e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  70.39 
 
 		 205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  70.95 
 
 		 205 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  70.39 
 
 		 205 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  65.28 
 
 		 205 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  73.55 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  50.34 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  50.89 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  46.89 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  43.15 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.37 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  31.16 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  33.1 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.11 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  25.87 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  25 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  23.6 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2001  hypothetical protein  27.56 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.149993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>