More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2968 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.6 
 
 		 207 aa  307  9e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.38 
 
 		 209 aa  305  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.45 
 
 		 207 aa  305  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  67.63 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.93 
 
 		 207 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.63 
 
 		 210 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.63 
 
 		 210 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.63 
 
 		 210 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.42 
 
 		 209 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.46 
 
 		 209 aa  297  7e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  66.82 
 
 		 214 aa  297  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.84 
 
 		 227 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  36.18 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.82 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.41 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.41 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 		 205 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  39.49 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  37 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  40 
 
 		 223 aa  131  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  37.19 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  35.82 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  36.5 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  35.5 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  36 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  30.88 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.88 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  35.29 
 
 		 196 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0054  glutathione S-transferase like protein  38.04 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  33.96 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  31.58 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  31.19 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.34 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.96 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.98 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  34.5 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  32 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  32.21 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.26 
 
 		 219 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  32.85 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  32.85 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.06 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  30.58 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  31.19 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.25 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  30.54 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  31.07 
 
 		 181 aa  92  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  31.51 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.48 
 
 		 221 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  32.18 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.58 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  30.54 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  30.19 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  32.16 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  32.23 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  31.02 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  31.82 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.56 
 
 		 220 aa  88.6  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  30.5 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  31.92 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  27.78 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  31.94 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  29.52 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  30.54 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  29.95 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3580  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0483717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.33 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  25.25 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  27.1 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  28.5 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  30.59 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.83 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  32.87 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  31.48 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  28.24 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  28.85 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.72 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  33.18 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  31.19 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  29.72 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  28.71 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1303  glutathione S-transferase  30.69 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  29.86 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  31.71 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  33.01 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>