31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1518 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1518  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0597975  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0883  hypothetical protein  53.94 
 
 		 248 aa  274  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0932  hypothetical protein  53.09 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  58.33 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2896  hypothetical protein  52.32 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3247  hypothetical protein  52.94 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  53.07 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  53.07 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2993  amino acid ABC transporter periplasmic protein  51.48 
 
 		 249 aa  254  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2813  hypothetical protein  51.9 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3094  hypothetical protein  52.63 
 
 		 250 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  27.04 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.94 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.37 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.5 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.71 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  19.5 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  27.97 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  26.15 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.35 
 
 		 333 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  28.19 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2080  amino acid ABC transporter  24.71 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.13 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07039  hypothetical protein  23.33 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  23.98 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>