161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_24420  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
203 aa  421  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1446  phosphoserine phosphatase  69 
 
 
200 aa  296  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343477  normal  0.353206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0057  phosphoserine phosphatase  55.5 
 
 
203 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2053  phosphoserine phosphatase  55.78 
 
 
204 aa  235  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0818  phosphoserine phosphatase  53.27 
 
 
201 aa  226  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0583  phosphoserine phosphatase  51.98 
 
 
202 aa  224  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1581  phosphoserine phosphatase  52.5 
 
 
204 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.051516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1629  phosphoserine phosphatase  51.23 
 
 
204 aa  218  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3902  phosphoserine phosphatase  51.28 
 
 
205 aa  211  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3211  phosphoserine phosphatase  50.77 
 
 
204 aa  208  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3725  phosphoserine phosphatase  50.26 
 
 
191 aa  206  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0290  phosphoserine phosphatase  52.04 
 
 
201 aa  204  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1670  phosphoserine phosphatase  50.26 
 
 
205 aa  203  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.685249  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3550  phosphoserine phosphatase  49.74 
 
 
205 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41830  phosphoserine phosphatase  49.21 
 
 
205 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1390  phosphoserine phosphatase  48 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2544  phosphoserine phosphatase  48.69 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.938573  hitchhiker  0.0000142825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1758  phosphoserine phosphatase  48.17 
 
 
205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733968  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2079  phosphoserine phosphatase  48.17 
 
 
205 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22014  hitchhiker  0.00429675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2281  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  48.68 
 
 
237 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1112  phosphoserine phosphatase  34.02 
 
 
223 aa  121  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1255  hypothetical protein  45.65 
 
 
177 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  28.43 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  29.26 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  27.45 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  26.96 
 
 
429 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  26.96 
 
 
404 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  31.77 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  26.96 
 
 
429 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  28.42 
 
 
404 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  26.6 
 
 
429 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  28.96 
 
 
404 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  28.96 
 
 
415 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  30.86 
 
 
298 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  29.26 
 
 
404 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  27.87 
 
 
404 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  29.26 
 
 
398 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  28.3 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  25.4 
 
 
413 aa  58.2  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  26.32 
 
 
400 aa  58.2  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  27.13 
 
 
411 aa  58.2  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  27.13 
 
 
398 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  26.6 
 
 
400 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  25.26 
 
 
400 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  28.8 
 
 
419 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  30.38 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  27.66 
 
 
410 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  28.49 
 
 
297 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  28.79 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  28.19 
 
 
408 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1659  phosphoserine phosphatase SerB  29.31 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00929582  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  25.53 
 
 
309 aa  55.5  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  26.06 
 
 
410 aa  55.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0330  phosphoserine phosphatase SerB  27.04 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.414874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  27.13 
 
 
404 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2695  phosphoserine phosphatase SerB  27.92 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.687982  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  25 
 
 
411 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  26.15 
 
 
435 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  26.47 
 
 
412 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  30.67 
 
 
298 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1689  phosphoserine phosphatase SerB  28.42 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  25.53 
 
 
405 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0308  phosphoserine phosphatase SerB  26.53 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  28.19 
 
 
325 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  27.66 
 
 
419 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  28.8 
 
 
404 aa  52  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 
405 aa  52  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  27.66 
 
 
325 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  30.41 
 
 
297 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0208  phosphoserine phosphatase SerB  28.29 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00413015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  26.47 
 
 
406 aa  50.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  27.49 
 
 
325 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  26.74 
 
 
292 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  28.14 
 
 
325 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  26.84 
 
 
410 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1582  phosphoserine phosphatase SerB  26.44 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  27.32 
 
 
306 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  25.97 
 
 
330 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  27.32 
 
 
306 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  28.65 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  24.64 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  29.22 
 
 
298 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  25 
 
 
409 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  25.27 
 
 
213 aa  48.5  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  25.97 
 
 
330 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  24.47 
 
 
405 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  25.88 
 
 
295 aa  48.5  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  29.05 
 
 
297 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  27.11 
 
 
296 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  24.61 
 
 
291 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  28.07 
 
 
322 aa  48.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  26.9 
 
 
322 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  26.9 
 
 
322 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 
438 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  26.9 
 
 
322 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  26.9 
 
 
322 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  25.97 
 
 
330 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  26.9 
 
 
322 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  26.9 
 
 
322 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  29.87 
 
 
298 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>