216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23090 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23090  sulfite oxidase-like oxidoreductase  100 
 
 
521 aa  1075    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.334834  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16790  sulfite oxidase-like oxidoreductase  26.7 
 
 
529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.707001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0393  oxidoreductase molybdopterin binding  26.44 
 
 
560 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0298  oxidoreductase molybdopterin binding  27.09 
 
 
552 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0655  hypothetical protein  25.37 
 
 
539 aa  113  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.507478  normal  0.0435014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1092  oxidoreductase molybdopterin binding  27.45 
 
 
599 aa  111  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000472494 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1013  oxidoreductase molybdopterin binding  27.98 
 
 
599 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14191  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.03 
 
 
501 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03080  sulfite oxidase-like oxidoreductase  26.08 
 
 
535 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0476411  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  26.24 
 
 
407 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  28.37 
 
 
417 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  26.71 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  24.38 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.4 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  27.96 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  25.42 
 
 
408 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  24.05 
 
 
501 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.17 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.14 
 
 
512 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  25.61 
 
 
407 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  24.2 
 
 
409 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  24.67 
 
 
408 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  28.79 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  25.35 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  26.37 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  24.6 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  22.06 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  23.46 
 
 
414 aa  67  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  24.25 
 
 
534 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  25.54 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  23.67 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  26.53 
 
 
424 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.53 
 
 
505 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  24.11 
 
 
349 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  27.76 
 
 
489 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  27.66 
 
 
546 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  24.09 
 
 
409 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  24.24 
 
 
461 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  27.73 
 
 
361 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  24.24 
 
 
461 aa  63.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  25 
 
 
406 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.11 
 
 
512 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  21.05 
 
 
415 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  24.73 
 
 
420 aa  63.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  25.48 
 
 
505 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  25.54 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  24.81 
 
 
431 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0394  oxidoreductase molybdopterin binding  26.19 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.95 
 
 
521 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  24.34 
 
 
335 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  31.78 
 
 
531 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  22.46 
 
 
425 aa  61.6  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  26.73 
 
 
403 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  27.83 
 
 
367 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1091  oxidoreductase molybdopterin binding  24.31 
 
 
359 aa  60.8  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000278852 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0656  oxidoreductase molybdopterin binding  23.9 
 
 
343 aa  60.8  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  0.0126108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1014  oxidoreductase molybdopterin binding  24.9 
 
 
357 aa  60.1  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0972537  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  26.81 
 
 
402 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  23.46 
 
 
600 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  24.78 
 
 
400 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  24.42 
 
 
410 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.53 
 
 
531 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  33.94 
 
 
570 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  21.57 
 
 
412 aa  59.3  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  22.87 
 
 
408 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  21.91 
 
 
425 aa  58.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  22.87 
 
 
408 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  25.44 
 
 
423 aa  58.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  22.87 
 
 
408 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  26.53 
 
 
427 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  23.02 
 
 
445 aa  57.8  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  22.78 
 
 
554 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  30 
 
 
253 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  23.5 
 
 
408 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4330  oxidoreductase molybdopterin binding  29.41 
 
 
396 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591499  normal  0.212281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  22.87 
 
 
408 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  25.85 
 
 
230 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  25.27 
 
 
414 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  24.47 
 
 
429 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  23.32 
 
 
363 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25 
 
 
511 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  26.43 
 
 
242 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  26.37 
 
 
401 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  23.92 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  25.88 
 
 
873 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  23.72 
 
 
445 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  23.77 
 
 
505 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  22.42 
 
 
414 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  24.31 
 
 
411 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  24.14 
 
 
218 aa  54.3  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  21.24 
 
 
523 aa  54.3  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  25.32 
 
 
446 aa  54.3  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  23.85 
 
 
509 aa  53.5  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  25.36 
 
 
309 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.6 
 
 
414 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  25.58 
 
 
233 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  24.24 
 
 
430 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.6 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  23.15 
 
 
370 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>