75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16090 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  100 
 
 		 489 aa  1000    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.5 
 
 		 521 aa  460  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  40.75 
 
 		 505 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.05 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  31.43 
 
 		 364 aa  90.9  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  27.39 
 
 		 340 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  26.21 
 
 		 347 aa  89  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.55 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.62 
 
 		 330 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  25.74 
 
 		 353 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  25.44 
 
 		 331 aa  87.4  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  25.27 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  25.81 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.41 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  26.37 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  28.39 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.3 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  24.65 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  22.11 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  22.79 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  20.96 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  22.33 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  26.89 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  26.89 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  24.52 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  26.89 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  24.4 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  25.57 
 
 		 351 aa  67  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  25.12 
 
 		 332 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.89 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  25.57 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  28.57 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  24.71 
 
 		 334 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  25.69 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  27.14 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  25.23 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.49 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  21.55 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  23.6 
 
 		 381 aa  57  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  26.06 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  23.61 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  22.56 
 
 		 396 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.31 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  23.85 
 
 		 371 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  22.22 
 
 		 371 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  25.09 
 
 		 342 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  25.32 
 
 		 367 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  20.69 
 
 		 368 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  21.59 
 
 		 367 aa  52  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  20.69 
 
 		 368 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  26.73 
 
 		 362 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  26.39 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.43 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  25.96 
 
 		 280 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  28.7 
 
 		 290 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  28.68 
 
 		 292 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  25.11 
 
 		 412 aa  47.4  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  25.38 
 
 		 290 aa  47  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  30 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  29.41 
 
 		 279 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  28.57 
 
 		 279 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  29.41 
 
 		 279 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  26.72 
 
 		 284 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  20.41 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  27.61 
 
 		 285 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.79 
 
 		 383 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  26.72 
 
 		 284 aa  44.3  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  27.35 
 
 		 280 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  22.39 
 
 		 354 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  26.28 
 
 		 278 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  22.39 
 
 		 354 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.31 
 
 		 372 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  27.27 
 
 		 289 aa  43.9  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.35 
 
 		 280 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  26.87 
 
 		 279 aa  43.1  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>