46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04030 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  66.67 
 
 		 272 aa  354  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  36.65 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  33.95 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1319  hypothetical protein  26.7 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.643261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  31.55 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  31.16 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  27.98 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  29.44 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  32.56 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  29.44 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  27.52 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  27.52 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  27.52 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  28.92 
 
 		 346 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  26.45 
 
 		 1204 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  25.96 
 
 		 223 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  31.67 
 
 		 343 aa  52.8  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  29.23 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  29.23 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.23 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  29.23 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.23 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  29.74 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  27.33 
 
 		 689 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.72 
 
 		 219 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  24.3 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  27.54 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  25.1 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  29.89 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  29.14 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  26.4 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  29.41 
 
 		 222 aa  45.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  27.89 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  26.7 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  26.74 
 
 		 213 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 		 224 aa  42.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>