36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4035 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  35.87 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  37.11 
 
 
134 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  35.42 
 
 
133 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  34.38 
 
 
130 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  31.11 
 
 
316 aa  55.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3945  hypothetical protein  34.38 
 
 
130 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  29.67 
 
 
746 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  34.07 
 
 
130 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  29.91 
 
 
745 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  29.2 
 
 
132 aa  52  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  32.29 
 
 
130 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2681  secreted protein-like  31.86 
 
 
412 aa  50.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593103  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  29.67 
 
 
745 aa  50.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  27.07 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  35.23 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  31.17 
 
 
741 aa  49.3  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  32.14 
 
 
201 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0078  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  48.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.984341  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2108  secreted protein-like protein  30.09 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  34.88 
 
 
130 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1079  putative lipoprotein  32.53 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  25.52 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1242  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1409  secreted protein  28.77 
 
 
269 aa  45.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.894228  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2068  hypothetical protein  30.48 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  33.72 
 
 
190 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0916  hypothetical protein  34.15 
 
 
288 aa  44.7  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.964057  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1242  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0929  hypothetical protein  31.36 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0056852 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1363  hypothetical protein  32.61 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2202  secreted protein-like protein  28.12 
 
 
136 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1262  secreted protein-like protein  33.33 
 
 
127 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4152  hypothetical protein  27.66 
 
 
132 aa  41.2  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337445  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1423  hypothetical protein  34.25 
 
 
160 aa  41.2  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2464  hypothetical protein  30 
 
 
139 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>