44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3774 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  100 
 
 		 1234 aa  2497    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  26.87 
 
 		 1079 aa  115  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1102 aa  108  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  29.47 
 
 		 1070 aa  107  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1080 aa  104  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  27.08 
 
 		 1104 aa  102  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  30.25 
 
 		 1061 aa  101  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  29.63 
 
 		 1061 aa  99  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  26.6 
 
 		 1094 aa  95.9  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  28.19 
 
 		 1144 aa  64.3  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  25 
 
 		 1169 aa  59.7  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  23.31 
 
 		 1224 aa  54.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  28.81 
 
 		 1300 aa  54.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1265 aa  53.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1210 aa  52  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1265 aa  50.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1266 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1266 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1266 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1266 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1266 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1290 aa  48.9  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  24.63 
 
 		 995 aa  48.9  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1088 aa  48.5  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1277 aa  48.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1284 aa  48.5  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1284 aa  48.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1091  hypothetical protein  23.5 
 
 		 853 aa  47.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1291 aa  47  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1266 aa  46.2  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  20.89 
 
 		 1095 aa  46.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1266 aa  46.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1266 aa  46.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  36.21 
 
 		 1266 aa  46.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1266 aa  46.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1266 aa  46.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1266 aa  46.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1266 aa  46.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  36.21 
 
 		 1266 aa  46.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1384 aa  45.8  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1276 aa  45.8  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1273 aa  45.8  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1273 aa  45.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1276 aa  45.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>