More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2589 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 646 aa  1326    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  44.17 
 
 		 634 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  42.37 
 
 		 636 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  41.37 
 
 		 643 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  41.62 
 
 		 639 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  41.95 
 
 		 645 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  40.99 
 
 		 647 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  42.5 
 
 		 619 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  40.2 
 
 		 640 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  38.42 
 
 		 642 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  39.38 
 
 		 611 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  39.18 
 
 		 602 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  36.41 
 
 		 638 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  37.46 
 
 		 645 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.05 
 
 		 609 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  36.63 
 
 		 636 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  38.7 
 
 		 633 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  36.76 
 
 		 632 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  38.59 
 
 		 646 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  38.73 
 
 		 755 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  35.44 
 
 		 631 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.24 
 
 		 618 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  39.28 
 
 		 646 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  39.25 
 
 		 802 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  39.19 
 
 		 809 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  39.25 
 
 		 802 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  39.27 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  38.35 
 
 		 646 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  39.25 
 
 		 802 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  38.83 
 
 		 756 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  35.06 
 
 		 627 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  39.27 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  35.46 
 
 		 637 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  36.35 
 
 		 637 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  37.4 
 
 		 764 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  39.25 
 
 		 802 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  39.19 
 
 		 803 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  38.35 
 
 		 761 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  39.02 
 
 		 803 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.49 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  38.86 
 
 		 802 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  39.8 
 
 		 682 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  38.35 
 
 		 775 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  34.91 
 
 		 634 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  33.65 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  38.51 
 
 		 760 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  38.51 
 
 		 765 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 		 618 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 		 618 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  38.51 
 
 		 765 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  35.48 
 
 		 618 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  33.82 
 
 		 633 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  33.82 
 
 		 633 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  37.14 
 
 		 600 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  37.58 
 
 		 648 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  38.51 
 
 		 681 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  35.15 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  36.83 
 
 		 597 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  33.82 
 
 		 633 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  35.91 
 
 		 638 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  33.82 
 
 		 633 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 		 630 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  33.82 
 
 		 633 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  36.5 
 
 		 607 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  33.82 
 
 		 633 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  35.3 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  39.3 
 
 		 684 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  38.13 
 
 		 627 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  33.93 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  34.26 
 
 		 618 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  33.82 
 
 		 633 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  33.82 
 
 		 633 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  39.96 
 
 		 595 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  33.82 
 
 		 633 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  38.66 
 
 		 626 aa  389  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  37.48 
 
 		 800 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  35.09 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  35.58 
 
 		 629 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  36.54 
 
 		 631 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  39.3 
 
 		 684 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  33.68 
 
 		 623 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  33.68 
 
 		 623 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  36.27 
 
 		 630 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  32.85 
 
 		 633 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 		 678 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  34.91 
 
 		 631 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 		 631 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  32.85 
 
 		 633 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  34.73 
 
 		 631 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  35.9 
 
 		 629 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  37.16 
 
 		 640 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  33.68 
 
 		 623 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  37.73 
 
 		 619 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  32.85 
 
 		 633 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  36.02 
 
 		 629 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  35.28 
 
 		 610 aa  382  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  34.3 
 
 		 628 aa  382  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>