24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2552 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2552  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3430  hypothetical protein  30.28 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  30.68 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  38.98 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  35.54 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  32.41 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  34.52 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  31.18 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  34.18 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  37.66 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  36.51 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  36 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  31.76 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  27 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  31.54 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  33.72 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  39.68 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  25.64 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  39.68 
 
 		 145 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  34.43 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.8 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  39.68 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3286  hypothetical protein  26.77 
 
 		 187 aa  41.2  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>